Először is, a beágyazott ipari számítógép elhelyezkedése a teljes mérési és vezérlőrendszerben gyakran az elülső végén van. A beágyazott ipari számítógép felfelé irányuló kapcsolata gyakran egy közönséges ipari számítógép. A számítási teljesítmény, a szoftverforrások, az adatbázis-támogatás és a szokásos ipari számítógép egyéb aspektusai beágyazódnak Nehéz elérni az ipari számítógépet.
Másodszor, a nagyméretű rendszerek építése során a szokásos ipari számítógépek rendszerbővítési képességeit és hálózati kommunikációs képességeit is nehéz beágyazott ipari számítógépekkel helyettesíteni. Ezenkívül a vizuális tervezés, a folyamatfigyelés, az adatstatisztikák, a tudományos számítástechnika, a prototípus szimulációs tervezés és az in-loop szimuláció területén a közönséges ipari számítógépeknek eredendő előnyei vannak.
